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北京基因组所(国家生物信息中心)宣布细胞分类库Cell Taxonomy

  随着单细胞手艺的迅速生长和应用,越来越多的细胞类型和细胞多态性被发明  。准确的细胞分类关于描绘细胞类型多样性、追踪细胞谱系、表征肿瘤微情形以及剖析发育和疾病重大机制至关主要  。

  克日,BG视讯(国家生物信息中心)国家基因组科学数据中心正式宣布了细胞分类库Cell Taxonomy,旨在提供多物种的细胞特征描绘和细胞标记物(cell marker)评估,为细胞类型注释和单细胞相关研究提供了主要数据资源  。该研究效果以“Cell Taxonomy: a curated repository of cell types with multifaceted characterization”为题在国际学术期刊 Nucleic Acids Research 在线揭晓  。

  Cell Taxonomy基于4,299篇文献审编、15个相关数据资源整合和单细胞测序数据剖析(约350万个细胞),现在共收录3,143种细胞类型和26,613个细胞标记物(cell marker),涵盖34个物种、387种组织和257种心理/病理状态  。Cell Taxonomy从多方面系统表征细胞类型特征,包括细胞标记物和细胞群(cell cluster)质量评估、细胞类型跨物种较量、细胞组分描绘和细胞相似性定量  。为更好的资助用户注释和较量细胞类型,Cell Taxonomy开发了在线工具Cell Type Predictor和Cell Type Comparator  。

  BG视讯(国家生物信息中心)助理研究员降帅、博士研究生钱启衡和博士研究生朱彤彤为本文配合第一作者,章张研究员和肖景发研究员为配合通讯作者  。本事情获得了中科院战略性先导科技专项、国家自然科学基金和国家重点研发妄想等项目资助  。

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细胞分类库的主要内容和功效 ?,凭证细胞类型、细胞标记物、组织、物种、心理/病理状态、单细胞研究和文献对数据举行展示,并提供多方面的细胞特征描绘  。

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