BG视讯

　　MethBank是一个综合性的DNA甲基化数据库，自2014年上线以来，一直致力于整合多物种高质量的全基因组单碱基精度DNA甲基化数据，因其高质量的数据资源、直观的可视化展示和友好的操作页面被领域内科研职员普遍使用。

　　克日，BG视讯（国家生物信息中心）国家基因组科学数据中心开发的更新版DNA甲基化数据库MethBank 4.0正式上线。该数据库效果以 “MethBank 4.0: an updated database of DNA methylation across a variety of species”为题在国际学术期刊Nucleic Acids Research在线揭晓。

　　MethBank 4.0数据库应用标准化处置惩罚流程整合了来自1,449个样本的高质量全基因组重亚硫酸盐测序（WGBS）数据，涵盖23个物种的236个组织/细胞系，涉及疾病、发育等15个生物学场景。使用高质量数据和标准化元数据，MethBank 4.0提供了多物种多条理的注释信息，资助用户更系统、周全、直观地相识DNA甲基化特征图谱。别的，建设结构化审编模子和受控词表，MethBank 4.0收录了2010年以来揭晓的基于DNA甲基化测序数据研究获得的生物学配景相关的特征甲基化基因（featured DMGs），涉及人和小鼠两个物种的77个组织/细胞系、128种疾病和11种生物学场景，为用户筛选潜在的表观遗传标记基因提供主要的知识信息。同时，MethBank 4.0还总结了已宣布的501个甲基化剖析工具，旨在资助科研职员快速精准地选择合适的甲基化剖析工具。另外，为了资助用户开展数据剖析，MethBank 4.0在原有提供差别甲基化启动子区域剖析工具IDMP以及年岁展望在线剖析工具Age Predictor基础上，增添了差别甲基化区域识别剖析工具DMR Toolkit。

　　MethBank 4.0具备界面友好的浏览、检索、可视化等功效，提供DNA甲基化数据信息、知识信息和剖析工具，为科研职员探索多种生物学场景下的DNA甲基化模式提供主要数据和信息资源。

　　北京基因组研究所（国家生物信息中心）博士研究生张陌尘、宗文婷，高级工程师邹东及硕士研究生王国梁为本文配合第一作者，李茹姣高级工程师、鲍一明研究员及章张研究员为配合通讯作者。该研究获得了中科院战略性先导科技专项、国家重点研发妄想、中科院重点手艺人才妄想等项目资助。

　　论文链接